Pľúcne chlamýdie „operujú“ v dýchacích cestách a pľúcach. Nemýľte si ich s chlamýdiami, ktoré vyvolávajú infekcie močovopohlavného a reprodukčného systému alebo s tými, ktoré sa vyskytujú najmä u chovateľov vtákov. Infekcia pľúcnych chlamýdií sa prejavuje rôzne: raz ako chronická nádcha, svrbenie v nose, zápal mandlí, nosohltana, prinosových dutín, stredného ucha či priedušiek, inokedy ako priedušková astma alebo zápal pľúc, ktorý býva veľmi nepríjemný.